西安交通大学医学中心（原西安医科大学）为社会尤其是西北地方提供优质的医学教育及临床医疗服务，是国家医学重点院校之一，西北地方首选。该校创建于 1937 年。 70 年来已为国家培养四万余名医学专门人才，所培养学生素以基本功扎实、操作能力强而闻名。设有医学院、附属第一、二医院和附属口腔医院，共有 9 个国家、省部级重点学科。有博士点 19 个，硕士点 41 个。目前开设临床医学等八项学士学位和多项研究生课程，另设七年制临床医学本硕连读课程。本年度将启动以我国生理学创始人之一、前任院 ( 校 ) 长 侯宗濂 教授名字命名的“宗濂医学班”——八年制本硕博连读课程。
生理学与病理生理学系
该系为著名生理学家 侯宗濂 教授初创，在国内外享有盛誉。该系在痛觉、味觉、肌梭功能、学习记忆及心脏病理生理方面之研究，基础雄厚，处于国家先进行列。
遗传学与分子生物学系
该系在教学与科研上力求卓越，科研实力雄厚，成果显著。
免疫学与病原生物学系
该系是陕西省及学校重点学科。教学与科研实力雄厚，在肿瘤病毒分子遗传学与免疫生理学等方面研究，卓有建树。
法医学系
该系为法医学国家重点学科，其教学与科研实力在国内名列前茅。曾参与国际人类基因组科研课题。该系注重为社会服务，设立全国法医干部培训中心、法医学司法鉴定中心。
人体解剖学与组织胚胎学系
该系除提供优质教学外，在神经血管偶联、脑损伤和修复等数项实验研究中，获得过重要研究成果，其杀精避孕剂的研究属国际领先水准。
公共卫生系
该系适应时代的要求，广泛开展公共卫生与预防医学方面的研究，且成果斐然。该系注重与国际同行的合作交流。
药理学系
该系师资实力雄厚，开展离子通道药理学、细胞与分子受体学、心脑缺血与抗心脑缺血药物、血管药理学等方向的研究。
病理学系
该系集传统病理学与现代病理学、分子病理学于一体，拥有在分子、细胞、器官及整体水准上进行综合性、系统性研究的能力
护理系
该系是国家建立最早、实力很强的本科护理专业教育基地之一，亦是国家首批护理硕士培养基地之一。该系与美国、加拿大、泰国及香港等同类院校有广泛的合作。
药学系
该系承担药物分析、生药学、药剂学、药事管理等优质课程。有国家中医药管理局中药分析等重点实验室。
附属第一医院
该院始建于 1956 年，是西北地方最大的卫生部直属综合性三甲医院，素以医术精湛、治学严谨、优质服务在广大群众中享有很高声誉。该院有 1 个教育部重点实验室（心内科实验室）， 5 个卫生部临床学科建设重点项目， 3 个省级重点学科（心内科、泌尿外科、妇产科）， 5 个省级优势学科（影像医学、普通外科学、传染病学、肿瘤学、神经外科学）。该院各种内镜、腔镜诊疗技术，血液净化治疗方式（如：血液透析、腹膜透析、血浆置换、人工技术），肾移植、肝移植、骨髓移植、小肠移植、心脏移植等器官移植技术，各种介入治疗方法，微创外科治疗技术，伽玛刀等先进诊疗技术的广泛开展，使医院在疾病的诊治上具有突出优势。该院综合实力在全国处于先进水准，心血管疾病、肾脏移植、血液疾病、麻醉、病理、护理、消毒供应 7 个专业为陕西省医院品质控制中心，部分医疗技术专案已达国内或西北地方领先水准。
附属第二医院
该院创建于 1938 年，是卫生部直属的一所集医疗、教学、科研、预防保健及社区服务为一体的大型综合性国家三级甲等医院。同时也是国家药理实验基地、卫生部国际紧急救援中心网路医院、卫生部与联合国儿童基金会及世界卫生组织爱婴医院。 该院在近 70 年的创业历程中形成了自己独特的医疗特色和医德传统，在西北地方乃至全国始终享有较高的学术地位和知名度。在皮肤科学、骨科学、耳鼻喉科学、眼科学等诊疗与临床教学领域中，有明显优势。
附属口腔医院
该院是卫生部直属的集教学、医疗、科研、预防和保健为一体的口腔专科医院，是西北地方口腔医学专业师资培训中心，及卫生部口腔医学继续教育基地之一，为陕西省口腔医疗品质控制中心、陕西省牙病防治指导小组挂靠单位。该院在耳鼻器官再造、颌面外科整形美容、头颈部肿瘤、颞颌关节紊乱症、牙周病、口腔粘膜病、义齿修复、牙列正畸、牙种植、小儿牙病等疑难杂病的诊断、治疗和技术方面具有特色，处于国内先进行列。
